Intestinale Immunregulation

 / Forschung

Intestinale Immunregulation

Wir untersuchen die Rolle von T-Helfer-(Th)-Zellen bei immunvermittelten Krankheiten. Mit neuen Ansätzen zur direkten Analyse antigenreaktiver Th-Zellen versuchen wir zu verstehen, warum die Toleranzmechanismen des Immunsystems bei Patienten mit chronischen Entzündungskrankheiten versagen.

Gruppenleitung:

Petra 
Bacher

Prof. Dr. rer. nat.

Gruppenmitglieder:

Theresa 
Dittmers

M.Sc.
Nick 
Funcke
Mikhail 
Goncharov

M.Sc.
Philipp 
Hofmann

M.Sc.
Hanna 
Isenberg

M.Sc
Juilee 
Kale
Gabriela Rios 
Martini

M.Sc.
Hanna 
Marutz

M.Sc.
Sarah 
Müller

Technician
Diana Milagros  
Namuch Castro

B.Sc.
Laura 
Rathjens

M.Sc.
Ekaterina 
Tikhonova

M.Sc.
Theresa 
von Oven

M.Sc
Amos 
Weichberger

Unser Forschungsschwerpunkt liegt auf der Rolle antigenspezifischer Th-Zellen in der menschlichen Immunabwehr. T-Helfer-(Th)-Zellen sind zentrale Organisatoren der Immunantwort. Über ihren T-Zell-Rezeptor sind sie in der Lage, ein bestimmtes Antigen zu erkennen. Durch die Freisetzung verschiedener Effektorzytokine können sie eine dem Antigen entsprechende Immunantwort auslösen. Unangemessene oder zu starke Immunreaktionen können jedoch zu Immunpathologien wie Autoimmunität, chronischen Entzündungen oder Allergien führen. Eine spezialisierte Th-Zell-Subpopulation, die regulatorischen T-Zellen (Tregs) hingegen, haben suppressive Eigenschaften. So können sie die Immunantwort gegen ein bestimmtes Antigen abschwächen oder sogar verhindern.

Welche T-Zellen jedoch auf ein bestimmtes Antigen reagieren, welche Antigene überhaupt erkannt werden und wie die schützende Immunität und Toleranz erhalten oder gestört wird, ist in vielen klinischen Situationen nicht bekannt. Mit neuen Ansätzen zur direkten ex vivo Analyse von antigen-reaktiven Th-Zellen versuchen wir zu verstehen, warum bei Patienten mit chronisch entzündlichen Erkrankungen, wie entzündlichen Darmerkrankungen oder Allergien, die Toleranzmechanismen versagen. Durch Kombination der antigen-reaktiven Th-Zellanalyse mit leistungsstarken, hochmodernen Analyse-Technologien, wie multidimensionaler Durchfluss-Zytometrie, (Einzelzell-) Transkriptomik, TCR-Sequenzierung und Proteomik können wir umfassende Informationen der einzelnen antigen-reaktiven Th-Zellen mit hoher Sensitivität und Spezifität erhalten, um so das Zusammenspiel von Umweltfaktoren mit mikrobiellen und entzündlichen Prozessen, die zu Dysfunktionen und chronischen Entzündungen führen, aufzuklären. Unser Ziel ist es, durch die Analyse dieser grundlegenden Prozesse direkt in den Zellen des menschlichen Immunsystems, die Entwicklung neuer diagnostischer und therapeutischer Strategien für chronische Entzündungskrankheiten, Autoimmunität oder Allergien beschleunigen.

  • Menschliche T-Zell-Antworten gegen Mikrobiota
  • Rolle antigen-spezifischer T-Zellen in chronisch entzündlichen Erkrankungen
  • Molekulare Regulation von Mikrobiota-reaktiven T-Zellen
  • Induktion und funktionelle Charakterisierung humaner antigen-spezifischer Th17-Subsets
  • Orale Toleranz durch Nahrungsmittel-spezifische T-Zellen

1.Focus on fungi

Iliev ID, Brown GD, Bacher P, Gaffen SL, Heitman J, Klein BS, Lionakis MS. Cell. 2024; 187:5121.

2.Autoantigen-specific CD4+ T cells acquire an exhausted phenotype and persist in human antigen-specific autoimmune diseases

Saggau C, Bacher P, Esser D, Rasa M, Meise S, Mohr N, Kohlstedt N, Hutloff A, Schacht SS, Dargvainiene J, Martini GR, Sturner KH, Schroder I, Markewitz R, Hartl J, Hastermann M, Duchow A, Schindler P, Becker M, Bautista C, Gottfreund J, Walter J, Polansky JK, Yang M, Naghavian R, Wendorff M, Schuster EM, Dahl A, Petzold A, Reinhardt S, Franke A, Wieczorek M, Henschel L, Berger D, Heine G, Holtsche M, Haussler V, Peters C, Schmidt E, Fillatreau S, Busch DH, Wandinger KP, Schober K, Martin R, Paul F, Leypoldt F, Scheffold A. Immunity. 2024; 57:2416.

3.Antigen specificity and cross-reactivity drive functionally diverse anti-Aspergillus fumigatus T cell responses in cystic fibrosis

Schwarz C, Eschenhagen P, Schmidt H, Hohnstein T, Iwert C, Grehn C, Roehmel J, Steinke E, Stahl M, Lozza L, Tikhonova E, Rosati E, Stervbo U, Babel N, Mainz JG, Wisplinghoff H, Ebel F, Jia LJ, Blango MG, Hortschansky P, Brunke S, Hube B, Brakhage AA, Kniemeyer O, Scheffold A, Bacher P. J Clin Invest. 2023; 133:e161593.

4.Selection of cross-reactive T cells by commensal and food-derived yeasts drives cytotoxic TH1 cell responses in Crohn’s disease

Martini GR, Tikhonova E, Rosati E, DeCelie MB, Sievers LK, Tran F, Lessing M, Bergfeld A, Hinz S, Nikolaus S, Kümpers J, Matysiak A, Hofmann P, Saggau C, Schneiders S, Kamps AK, Jacobs G, Lieb W, Maul J, Siegmund B, Seegers B, Hinrichsen H, Oberg HH, Wesch D, Bereswill S, Heimesaat MM, Rupp J, Kniemeyer O, Brakhage AA, Brunke S, Hube B, Aden K, Franke A, Iliev ID, Scheffold A, Schreiber S, Bacher P. Selection of cross-reactive T cells by commensal and food-derived yeasts drives cytotoxic TH1 cell responses in Crohn’s disease. Nat Med. 2023; 29:2602.

5.The pre-exposure SARS-CoV-2-specific T cell repertoire determines the quality of the immune response to vaccination

Saggau C, Martini GR, Rosati E, Meise S, Messner B, Kamps AK, Bekel N, Gigla J, Rose R, Voß M, Geisen UM, Reid HM, Sümbül M, Tran F, Berner DK, Khodamoradi Y, Vehreschild MJGT, Cornely O, Koehler P, Krumbholz A, Fickenscher H, Kreuzer O, Schreiber C, Franke A, Schreiber S, Hoyer B, Scheffold A, Bacher PImmunity. 2022; 55:1924.

6.Low-Avidity CD4+ T Cell Responses to SARS-CoV-2 in Unexposed Individuals and Humans with Severe COVID-19

Bacher P, Rosati E, Esser D, Rios-Martini G, Saggau C, Schiminsky E, Dargvainiene J, Schöder I, Wieters I, Khodamoradi Y, Eberhardt F, Vehreschild MJGT, Neb H, Sonntagbauer M, Conrad C, Tran F, Rosenstiel P, Markewitz R, Wandinger, K-P, Augustin M, Rybniker J, Kochanek M, Leypoldt F, Cornely OA, Koehler P, Franke A, Scheffold A. Immunity. 2020; 53:1258.

7.Human Anti-fungal Th17 Immunity and Pathology Rely on Cross-Reactivity against Candida albicans

Bacher P, Hohnstein T, Beerbaum E, Röcker M, Blango MG, Kaufmann S, Röhmel J, Eschenhagen P, Grehn C, Seidel K, Rickerts V, Lozza L, Stervbo U, Nienen M, Babel N, Milleck J, Assenmacher M, Cornely OA, Ziegler M, Wisplinghoff H, Heine G, Worm M, Siegmund B, Maul J, Creutz P, Tabeling C, Ruwwe-Glösenkamp C, Sander LE, Knosalla C, Brunke S, Hube B, Kniemeyer O, Brakhage AA, Schwarz C, Scheffold A. Cell. 2019; 176:1340.

8.A novel unconventional T cell population enriched in Crohn’s disease.

Rosati E, Rios Martini G, Pogorelyy MV, Minervina AA, Degenhardt F, Wendorff M, Sari S, Mayr G, Fazio A, Dowds CM, Hauser C, Tran F, von Schönfels W, Pochhammer J, Salnikova MA, Jaeckel C, Gigla JB, Sabet SS, Hübenthal M, Schiminsky E, Schreiber S, Rosenstiel PC, Scheffold A, Thomas PG, Lieb W, Bokemeyer B, Witte M, Aden K, Hendricks A, Schafmayer C, Egberts JH, Mamedov IZ, Bacher P, Franke A. Gut. 2022; 71:2194.

9.Regulatory T Cell Specificity Directs Tolerance versus Allergy against Aeroantigens in Humans

Bacher P, Heinrich F, Stervbo U, Nienen M, Vahldieck M, Iwert C, Vogt K, Kollet J, Babel N, Sawitzki B, Schwarz C, Bereswill S, Heimesaat MM, Heine G, Gadermaier G, Asam C, Assenmacher M, Kniemeyer O, Brakhage AA, Ferreira F, Wallner M, Worm M, Scheffold A. Cell. 2016; 167:1067.

 

Prof. Dr. rer. nat. Petra Bacher

  • Exzellenzcluster „Precision Medicine in Chronic Inflammation“ (PMI) (EXC 2167-390884018)“
  • DFG SFB1700/1 TP  B02: The role of microbiota-specific T cells as inflammatory drivers of hepatic au-toimmune diseases
  • DFG FOR5042 BA 6852/2-2: Targeting intestinal yeasts and pathogenic yeast responsive CD4+ T cells in Crohn‘s disease
  • EU miGutHealth: Proof of concept human study: dietary intervention to modify intestinal inflammation in IBD
  • DFG TRR 355: Induction of Antigen-specific Treg cell responses against airborne antigens
  • DFG TRR 241: Dissecting microbial subcellular structures as targets for specific Treg-based therapies
  • Sanofi GlobalT2 Grant: Identifying microbial targets of pathogenic CD4+ T-cell responses in atopic dermatitis
  • ERC ERC-StG MicroT: Microbiota-T cell interactions – antigen-specificity and regulation in health and disease
  • DFG CRU 5010: The Yin and Yang of anti-cancer CD4+ T cell responses in ALL
  • DFG SFB 1526: Microbiota-specific T cell responses in pemphigoid diseases
  • ERC-StG MicroT: Microbiota-T cell interactions – antigen-specificity and regulation in health and disease
  • CRU 5010: “Towards a Cure for Adults and Children with Acute Lymphoblastic Leukemia” (CATCH-ALL). Project: The Yin and Yang of anti-cancer CD4+ T cell responses in ALL
  • SFB 1526: „Pathomechanisms of Antibody-mediated Autoimmunity (PANTAU) – Insights from Pemphigoid Diseases”. B08: Microbiota-specific T cell responses
  • DFG: A pathogen-specific CD4 T cell atlas for chronic inflammatory diseases
  • FOR 5042: ”The microbiome as a therapeutic target in inflammatory bowel disease” (miTarget). P1: Early microbiome changes and its antigenic potential in individuals at high-risk for inflammatory bowel diseases
  • Exzellenzcluster „Precision Medicine in Chronic Inflammation“ (PMI) (EXC 2167-390884018). Integrative Immunogenetics and Cellular Approaches towards Developing an Antigen-Specific Therapy
  • Dr. Mario Assenmacher, Marco Vahldieck, Jennifer Pankratz; Miltenyi Biotec GmbH, Bergisch Gladbach, Germany
  • Prof. Axel Brakhage, Dr. Olaf Kniemeyer; Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie (HKI), Jena, Germany
  • Prof. Oliver Cornely, Angela Steinbach; Klinik I für Innere Medizin, Uniklinik Köln, Köln, Germany
  • Prof. Andre Franke, Elisa Rosati; Institut für Klinische Molekularbiologie, CAU Kiel, Germany
  • Prof. Dr. Guido Heine, UKSH Campus Kiel, Klinik für Dermatologie, Venerologie und Allergologie
  • Prof. Bernhard Hube, Dr. Sascha Brunke; Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie (HKI), Jena, Germany
  • Dr. Iliyan Iliev, Associate Professor of Microbiology and Immunology in Medicine; Weill Cornell Medical College, New York, USA
  • Dr. Jochen Maul, Medizinische Klinik für Gastroenterologie, Infektiologie und Rheumatologie CBF, Charité – Universitätsmedizin Berlin, Berlin, Germany
  • Prof. Alexander Scheffold; Institut für Immunologie, CAU Kiel, Germany
  • Dr. Bernd Schnabl, Professor of Medicine; University of California, UC San Diego School of Medicine, San Diego, USA
  • Prof. Dr. Christoph Schramm; Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf, Zentrum für Innere Medizin, 1. Med. Klinik und Poliklinik (Gastroenterologie mit Sektionen Infektiologie und Tropenmedizin), Hamburg, Germany
  • Prof. Dr. Stefan Schreiber, PD Dr. Konrad Aden; Universitätsklinikum Schleswig-Holstein, Klinik für Innere Medizin I, Institut für Klinische Molekularbiologie (IKMB), Kiel, Germany
  • Prof. Dr. Carsten Schwarz, Dr. med. Patience N. Eschenhagen; Klinikum Westbrandenburg, Mukoviszidosezentrum, Potsdam, Germany